Çin’in Wuhan kentindeki bir pazardan elde edilen genetik veriler üzerine yapılan yeni bir araştırma, verilerin salgının yasa dışı olarak ticareti yapılan hayvanlarla başladığı iddiasını desteklemediğini belirterek, diğer bilim adamlarının yapbozun kritik parçaları olarak gördüğü örnekler hakkında yeni tartışmalara değindi. koronavirüs insanlara ulaştı.
bu yeni çalışma2020’nin başlarında pazardaki yüzeylerden alınan sürüntülerdeki hayvansal ve viral materyalin nispi miktarlarını inceleyen , virüs örneklerinin enfekte canlı hayvanlardan mı yoksa sadece tesadüfi kontaminasyondan mı geldiğine dair sonuçlara varmanın zor olduğunu söyledi.
Ancak birkaç dış uzman, Fred Hutchinson Kanser Merkezi’nde bir virolog olan çalışmanın yazarı Jesse Bloom tarafından bu hafta çevrimiçi olarak yayınlanan analizin, bir dizi bilinmeyen değişkenden ve verilerin nasıl filtreleneceğine ilişkin kararlardan etkilenmiş olabileceğini söyledi.
Bu nedenlerden dolayı, bulguların önceki çalışmalara ilişkin izlenimlerini etkilemek için fazla bir şey yapmadığını söylediler. Hayvan ve viral genetik materyal içeren pazardan alınan numunelerin, oradaki bir hayvanın – belki bir rakun köpeğinin – virüsü insanlara yaymış olma olasılığıyla tutarlı olduğunu, ancak bunun olduğunu kanıtlamadığını söylediler.
Pennsylvania Üniversitesi’nde Wuhan’dan alınanlara benzer örnekleri analiz etmede uzman bir mikrobiyolog olan Frederic Bushman, “Enfekte bir rakun köpeği kapma şanslarının oldukça makul olduğunu düşünüyorum, ancak bu, kökenin bu olduğunu kanıtlamaz” dedi. pazar, ancak pazar araştırmalarının hiçbirine dahil olmayan. “Bloom gazetesinin düşüncelerimi o kadar değiştirdiğini düşünmüyorum.”
Çinli araştırmacılar piyasa verileri hakkında yazdı geçen yıl ve ardından bu yıl genetik dizileri kullanıma sunarak uluslararası bilim adamlarından oluşan bir ekibin bunları incelemesine izin verdi. o takım bir raporda yazdı Geçen ay verilere dayanarak, virüsü insanlara bulaştıran bir hayvanı kesin olarak tanımlayamadılar.
Ancak verilerin, rakun köpekleri ve yirmi yıl önce SARS salgınına karışan küçük bir Asya memelisi olan maskeli misk kedisi gibi virüse duyarlı olduğuna inanılan hayvanların 2019’un sonlarında pazarda satıldığını doğruladığını söylediler. En eski Covid-19 hastaları da pazarda çalıştı veya alışveriş yaptı.
Pazar, Wuhan’da virüsü makul bir şekilde yayabilecek türden canlı hayvanlar satıldığı bildirilen yalnızca dört yerden biri olduğu için, bilim adamları, bu kadar çok erken hastanın pazara tamamen şans eseri bağlanmasının olası olmadığını söylediler. Genetik verilerin, virüsün iki erken soyunun piyasada olduğu da dahil olmak üzere başka kanıtlara dayandığını söylediler.
Bu haftaki çalışma, gen dizilerini analiz etmek için farklı bir yaklaşım benimsedi.
Dr. Bloom, virüsten gelen genetik materyal miktarının, örneklerdeki duyarlı hayvan türlerinden elde edilen genetik materyal miktarı ile ilişkili olup olmadığını araştırdı. Bir röportajda, pazardaki tek bir türün virüsün yayılmasından ezici bir çoğunlukla sorumlu olması durumunda, virüsten gelen genetik materyal miktarı ile o türden gelen miktar arasında açık bir bağlantı görmeyi bekleyeceğini söyledi.
Ancak çalışma, bu türden net bir korelasyon bulamadı. Bunun yerine, en güçlü korelasyonlar, pazarda satılan ve enfekte olamayacak çeşitli balıkları içeriyordu; bu, enfekte kişilerin muhtemelen balığın olduğu yerde viral materyal biriktirdiğinin bir göstergesi.
Dr. Bloom, bulguların SARS-CoV-2 olarak da bilinen virüsün, 2020’nin başlarında sürüntü örnekleri toplandığında piyasada geniş çapta yayılmış olduğunu gösterdiğini söyledi.
“Aynı şekilde, çipura levrek ve yayın balığı örnekleriyle karıştırılmış bir grup SARS-CoV-2 olduğu gerçeğine pek bir şey okumamamız gerektiği gibi, bir rakun köpeği örneğinin olduğu gerçeğine de pek bir şey okumamalıyız. SARS-CoV-2 okumasıyla,” dedi Dr. Bloom.
Ancak dışarıdan uzmanlar, örneklerin çeşitli özelliklerinin hayvan ve viral materyal arasında bağlantı kurma çabalarını boşa çıkarabileceğini söyledi. Uluslararası bilim adamları raporlarında benzer bir analiz yapmayı düşündüklerini ancak bunun yanıltıcı sonuçlar verme riskini taşıdığını söylediler. Dr. Bloom, “bunun hesaplanmasının bilgilendirici bir şey olup olmadığı konusunda ucu açık bir soru olduğunu” kabul etti.
Weill Cornell Medicine’de çevresel numune alma uzmanı Christopher Mason, virüsün genetik materyalinin hızla bozulduğunu söyledi. En önemlisi, viral materyal hayvanlardan alınan materyalden farklı bir oranda bozunabilir ve bu da pazarın kapanmasından sonraki haftalar boyunca toplanan örneklerde bunların karşılaştırılmasını zorlaştırır.
Belçika’daki KU Leuven’de evrimsel bir biyolog olan Tom Wenseleers, balıkların virüsle en yakından ilişkili olmasının nedeninin, balıkların büyük olasılıkla donmuş veya buzdolabında olması ve bu örneklerdeki viral materyalin çürümesini yavaşlatması olabilir.
Dr. Wenseleers, “Son analiz, bu tür korelasyonlara bakmanın, hangi konakçı türün pandeminin makul bir kaynağı olabileceği konusunda size neredeyse hiçbir şey söylemediğini doğruluyor” dedi. Bu, bilim adamlarını daha önce olduğu gibi aynı durumda bırakıyor, dedi, herhangi bir belirli köken senaryosuna dair kesin kanıt sunmayan piyasa verileriyle.
Yeni çalışma ayrıca, uluslararası ekibin rakun köpeklerinin genetik imzalarının yanı sıra virüs izine rastladığı, ancak insanlardan saptanabilir genetik materyal bulunmadığı pazardaki bir arabadan alınan bir sürüntüyü de yakından inceledi.
Dr. Bloom, sürüntü örneğinin yalnızca çok az miktarda viral materyal içerdiğini ve Çinli araştırmacıların çubuğu neden Covid-pozitif olarak sınıflandırdığının net olmadığını yazdı. Çalışması, virüsün herhangi bir izine sahip önemli miktarda rakun köpeği genetik materyali içeren tek sürüntünün olduğunu söyledi.
Ancak bazı bilim adamları, Dr. Bloom’un analizinin, bir numunedeki hayvan genetik materyali miktarı için çıtayı çok yükseğe ayarlayarak diğer Covid-pozitif sürüntüleri göz ardı etme riski taşıdığını söyledi.
Pennsylvania Üniversitesi’nden Dr. Bushman, analizde kullanılan eşiğin “agresif” olduğunu ve bir dizi farklı eşikten elde edilen sonuçları karşılaştırmanın en iyisi olduğunu söyledi.
Uluslararası bilim insanları ekibi, daha hassas bir eşik kullanarak, rakun köpeği genetik materyali içeren çok sayıda Kovid-pozitif numunenin yanı sıra virüse duyarlı olduğu düşünülen farklı hayvanların genetik imzalarına sahip diğerleri belirledi.
Eskiden Johns Hopkins Üniversitesi’nde uluslararası ekibin analizine öncülük eden hesaplamalı bir biyolog olan Alexander Crits-Christoph, ekibin ayrıca Çinli araştırmacıların arabadan alınan sürüntüyü virüs için pozitif olarak tanımlamakta haklı olup olmadıklarını da yakından incelediğini söyledi.
Aynı duraktan alınan bir dizi başka sürüntünün virüs için açıkça pozitif olduğunu kaydetti. Pazardaki başka yerlerden alınan örneklerden elde edilen sonuçların, arabadan alınan eküvyonun aksine, gerçekten negatif olan eküvyonların çoğunun hiçbir virüs izi içermediğini gösterdiğini söyledi.
Crits-Christoph, “Bu, samanlıkta küçücük bir iğne olan bir virüsün çevresel örneklemesidir” dedi.